pozawątrobowe ognisko nowotworowe zaawansowana niewydolność serca lub niewydolność oddechowa aktywne uzależnienie od substancji psychoaktywnych utrudnienia anatomiczne uniemożliwiające od strony technicznej wykonanie zabiegu ciężkie zakażenia niemożliwe do wyleczenia niewydolność wielonarządowa choroby psychiczne Przeciwwskazania względne: niewydolność nerek zespół nabytego niedoboru odporności (AIDS) pierwotny rak wątrobowokomórkowy hemochromatoza spodziewany brak współpracy chorego lub rodziny bardzo głębokie niedożywienie białkowo-kaloryczne aktywne zakażenie poza drogami moczowymi zakażenie HBV z wysoką wiremią
Należy nadmienić, że względne przeciwwskazania są bardzo dyskusyjne.
Immunologia Wątroba jest narządem o niskiej immunogenności. Typowanie tkankowe przed przeszczepieniem nie jest stosowane. Dodatni wynik próby krzyżowej, czyli stwierdzenie przeciwciał dla antygenów HLA klasy I nie jest przeciwwskazaniem do przeszczepienia.
Obowiązuje tylko zgodność w zakresie grup krwi. W przypadkach przeszczepów ze wskazań pilnych wykonano zakończone powodzeniem przeszczepy przy braku zgodności grup krwi (w przypadku zabiegów planowych zgodność grup krwi wciąż obowiązuje).