Po wojnie był wielokrotnie szykanowany przez władze PRL, m.in. atakowany personalnie na konferencji otwockiej. W 1948 objęto go całkowitym zakazem publikowania prac. W 1957 roku opublikował artykuł „Pesymizm błędnych tez”, będący polemiką z partyjną historiografią i jej antyniepodległościowym nastawieniem. 30 września 1969 roku przeszedł na emeryturę, ale nie przerwał pracy naukowej i publicystyki historycznej. W latach 1969–1982 publikował na łamach „Tygodnika Powszechnego”, początkowo pod pseudonimem Adam Stor, później pod własnym nazwiskiem. W 1975 roku uległ ciężkiemu wypadkowi, i przez kilka miesięcy był przykuty do łóżka. W roku 1978 podpisał deklarację założycielską Towarzystwa Kursów Naukowych. Był autorem haseł w Polskim Słowniku Biograficznym i Słowniku biograficznym działaczy polskiego ruchu robotniczego.
Od czerwca 1947 roku był mężem Heleny z domu WaniczekHelena Wereszycka (1907–1995) K III-152 Inwentarz [dostęp 2026-01-16]..
Zmarł w Krakowie, pochowany 5 marca 1990 roku na cmentarzu Rakowickim (kwatera XIIIA-18-23).