9 grudnia 2006 podczas konferencji prasowej Andrzej Lepper stwierdził, że „Gazeta Wyborcza”, pewne ugrupowania polityczne oraz środowiska biznesu chciały dokonać zamachu stanu obalając legalnie wybrany rząd po to, aby uniemożliwić rozliczenie afer i wybranie nowego prezesa Narodowego Banku Polskiego. Ogłosił także, że będzie nalegał, by sprawą zajęła się Agencja Bezpieczeństwa Wewnętrznego. Wicepremier Andrzej Lepper zapowiedział również podanie do sądu Anety Krawczyk za pomówienie. Pogląd Andrzeja Leppera o próbie obalenia rządu podzielił wicepremier i minister edukacji narodowej Roman Giertych. Zapowiedział on złożenie projektu nowelizacji przepisów prawa prasowego tak, aby przyspieszyć tryb zamieszczania sprostowań, a redakcje dopuszczające się pomówień karać finansowo.

14 grudnia 2006 Stanisław Łyżwiński został, decyzją przewodniczącego partii wykluczony z Samoobrony RP.

2007 thumb|180px|Stanisław Łyżwiński 8 lutego 2007 badanie DNA Andrzeja Leppera wykazało, iż nie jest on ojcem najmłodszego dziecka Anety Krawczyk.

9 lutego 2007 łódzki sąd rejonowy aresztował na trzy miesiące radnego Samoobrony RP Jacka Popeckiego.