Po sezonie 2004/2005 z Austrii zaczęli odchodzić niektórzy zawodnicy. Był wśród nich także Afolabi, który za 2 miliony euro przeszedł do FC Sochaux-Montbéliard. W Ligue 1 zadebiutował w 3. kolejce ligowej, 13 sierpnia w wygranym 2:1 wyjazdowym meczu z OGC Nice. Nie był to jednak udany debiut, gdyż Afolabi otrzymał czerwoną kartkę w 87. minucie meczu. W 37. kolejce zdobył swoją pierwszą bramkę na francuskich boiskach, a jego drużyna 6 maja 2006 zremisowała na własnym stadionie z Troyes AC. Ogólnie dobrze wprowadził się do drużyny i oceny tej nie popsuł nawet fakt, że Sochaux straciło dużo bramek w lidze i zajęło dopiero 15. miejsce. W Sochaux Afolabi spędził cztery sezony.
Latem 2009 roku podpisał kontrakt z austriackim Red Bull Salzburg. W 2010 roku wywalczył z Red Bullem mistrzostwo Austrii, a w 2011 roku odszedł do drugoligowego AS Monaco.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki Rozgrywki Europy Mecze Bramki 1997 NEPA Lagos FC
2.