W tym czasie we wsi znajdowało się 5 karczm.
Kościół, zwany po łacinie Clausula Mariana (stąd nazwa wsi), znajduje na wzgórzu, między trzema jeziorami, zbudowany pierwszy raz podobno w roku 1354, przetrwał do 1754 r. „Proboszcz Jakonn Gross z Klus w sprawozdaniu do archiprezbitera Gizewiusza w Piszu z 1786 r. napisał, że przed kościołem wzniesionym w 1754 r. istniał „kościół wybudowany przez panów krzyżackich i mistrzów zakonnych w 54 r. XIV wieku” W sposób szczególny wyrażono określenie czasu wskazywać może na 1354 r. jednakże w tak dawnych czasach przypuszczalnie mogła być mowa jedynie o kaplicy. Potwierdza to również Toppen”KLUSY – Orzysz.pl.
Kościół w Klusach był parafią, która obejmuje do dziś: Klusy, Ogródek, Rostki, Skomack, Rogale, Rogalik, Rożyńsk, Lipińskie, Ruską Wieś, Gorzekały. W starostwie ryńskim było siedem parafii, z których pięć miało uposażenie po 4 łany, a dwie po 2 łany (Okartowo, Klusy), parafia w Klusach liczyła 453 łany (w 1631 r.). Podczas reformacji kościół w Klusach zajęli protestanci i założyli tu parafię. Współczesny to budowla neogotycka z roku 1884.