Coupé Drugą wersją Z3 było coupé. Cechowała je bardzo charakterystyczna linia nadwozia ze ściętym tyłem. Coupé wprowadzono do produkcji w 1999. Występowało tylko z silnikami o największych pojemnościach dostępnych w wersji z roadster, czyli 2.8 i 3.0. Równocześnie powstała usportowiona wersja M Coupé z silnikami S50B32 i S54B32.
Dane techniczne + Wersja Silnik: Układ zasilania: Średnica × skok tłoka: St. sprężania: Moc maksymalna: Maks. moment obrotowy 0–100 km/h: V-max: Nadwozie Silniki benzynowe: 1.8 R4 1,8 l (1796 cm³), SOHC wtrysk 84,00 × 81,00 mm 9,7:1 115 KM (85 kW) przy 5500 obr./min 168 N·m przy 3900 obr./min 10,5 s 194 km/h Roadster 1.9 R4 1,9 l (1895 cm³), DOHC wtrysk 85,00 × 83,5 mm 10,0:1 140 KM (103 kW) przy 6000 obr./min 180 Nm przy 4300 obr./min 9,5 s (man.)/10,5 (aut.) 205 km/h (man.)/ 196 km/h (aut.) Roadster1.9iR4 1.9 l (1895 cm³), SOHCwtrysk85,00 x 83,50 mm9,7:1118 KM (87 kW) przy 5500 obr./min180 Nm przy 3900 obr./min10,4 s196 km/hRoadster 2.0 R6 2,0 l (1991 cm³), DOHC wtrysk 80,00 × 66,00 mm 11,0:0 150 KM (110 kW) przy 5900 obr./min 190 Nm przy 3500 obr./min 8,9 s 210 km/h Roadster 2.2i R6 2,2 l (2171 cm³), DOHC wtrysk 80,00 × 72,00 mm 10,8:1 170 KM (125 kW) przy 6100 obr./min 210 Nm przy 3500 obr./min 7,9 s 224 km/h Roadster 2.5i R6 2,5 l (2490 cm³), DOHC wtrysk 84,00 × 74,90 mm 10,5:1 170 KM (125