Domeny F: Formylacja (opcjonalnie) NMe: Metylacja (opcjonalnie) A: Adenylacja (niezbędna w module) PCP: Tiolacja i białko przenoszące peptydy [Peptide Carrier Protein (PCP)] z dołączoną 4' –fosfo-panteteiną (niezbędna w module) C: Kondensacja wiązania peptydowego (niezbędna w module) Cy: Cyklizacja poprzez tlen lub siarkę (opcjonalnie) Ox: Utlenianie mostków siarczkowych/tlenowych (opcjonalnie) Red: Redukcja mostków siarczkowych/tlenowych (opcjonalnie) E: Epimeryzacja do D-aminokwasów (opcjonalnie) TE: Terminacja przez tioesterazę (znalezione tylko raz wśród NRPS) R: Redukcja do terminalnego aldehydu lub alkoholu (opcjonalnie)
Inicjacja Ładowanie: pierwszy aminokwas jest aktywowany przez ATP jako połączenie bezwodnika acylowo-fosforanowego z AMP przez domenę A i ładowany na dołączoną do seryny 4' –fosfopanteteinę (pochodzącą z koenzymu A i dołączoną tam w specyficznej reakcji aktywowania kompleksu).