AFP Rak wątrobowokomórkowy, nienasieniakowe guzy jądra, niewielki wzrost w nowotworach żołądka i jelit Podwyższony poziom możliwy w różnych schorzeniach wątroby β-hCG Choriocarcinoma, guzy zarodkowe jądra, neuroblastoma, nephroblastoma Diagnoza wymienionych nowotworów NSE Rak drobnokomórkowy płuca, neuroblastoma Wykorzystywany czasem przy stawianiu diagnozy; są jednak inne, pewniejsze metody PSA Rak gruczołu krokowego Antygen swoisty narządowo, ale występujący w różnych schorzeniach prostaty. Przydatny w monitorowaniu postępów choroby. CA 15-3 Rak sutka Marker stosunkowo mało czuły i nieswoisty CA 19-9 Nowotwory trzustki i dróg żółciowych, rak jelita Mało swoisty CA 125 Rak jajnika, rzadziej rak nerki, płuca Inne przyczyny: stany zapalne w miednicy mniejszej, endometrioza, ciąża, u osób zdrowych – zmienność osobnicza ER i PgR Rak piersi Bardzo istotne wskaźniki, określające zasadność hormonoterapii HER2 Rak piersi Bardzo istony; rozstrzyga o zasadności terapii trastuzumabem i lapatinibem. TdT Ostra białaczka limfoblastyczna Diagnoza przy białaczkach wywodzących się z limfocytów B.