Z Pucharu UEFA odpadło jednak już po pierwszej rundzie przegrywając z Parmą. Sezon 1999/2000 nie był również udany dla „Żółtych Kanarków”. Zajęli 4. miejsce i zostali wyprzedzeni nie tylko przez największych rywali – Galatasaray SK i Beşiktaş JK, ale także przez Gaziantepspor. W sezonie tym Okechukwu stracił miejsce w składzie i był na ogół rezerwowym, rozgrywając tylko 11 meczów w sezonie. W 2001 roku Uche z Fenerbahçe wywalczył swój drugi w karierze tytuł mistrzowski w Turcji. Co prawda zagrał tylko w 17 ligowych meczach, ale zdobył 5 goli, co uczyniło go jednym z najskuteczniejszych obrońców Superligi. Sezon 2001/2002 był ostatnim dla Okechukwu w barwach Fenerbahçe. W lidze Okechukwu zagrał tylko w 11 meczach i strzelił 2 gole i ze swoim klubem wywalczył wicemistrzostwo kraju. Zespół awansował do fazy grupowej Ligi Mistrzów, ale nie zdobywając punktu zajął ostatnie miejsce w swojej grupie.