ARP S.A. jest zaangażowana w transport kolejowy w Polsce. Agencja jest właścicielem spółki H. Cegielski – Fabryka Pojazdów Szynowych z siedzibą w Poznaniu, projektującej i wytwarzającej pojazdy szynowe. Od 2015 roku do Agencji należy większość (50% + 1 akcja) akcji w spółce Polregio S.A. (w latach 2015–2020 Przewozy Regionalne), obsługującej na zlecenie samorządów wojewódzkich ruch lokalnych i międzywojewódzkich pociągów osobowych. Pozostałe akcje w PolRegio należą do samorządów wojewódzkich.
W nadzorze właścicielskim ARP S.A. na rok 2024 znajdowały się 62 spółki, prowadzące różnorodną działalność gospodarczą.
ARP S.A. zarządza dwiema Specjalnymi Strefami Ekonomicznymi: Specjalną Strefą Ekonomiczną Euro-Park Mielec Tarnobrzeską Specjalną Strefą Ekonomiczną Euro-Park Wisłosan Od 2014 jest ona także większościowym akcjonariuszem w Warszawskich Zakładach Mechanicznych „PZL-WZM” w Warszawie S.A z siedzibą w Jawczycach.
ARP S.A. jest właścicielem Fundacji Pro Arte et Historia, która zarządza Zespołami Zamkowo-Parkowymi w Baranowie Sandomierskim i Krasiczynie.
Zgodnie z art. 13 ust. 1 ustawy z dnia 16 grudnia 2016 r. o zasadach zarządzania mieniem państwowym akcje lub prawa z akcji ARP S.A. należące do Skarbu Państwa nie mogą być zbyteUstawa z dnia 16 grudnia 2016 r.