XX wieku przyniosły drastyczny spadek przewozów zarówno osobowych, jak i towarowych, co pociągnęło za sobą niedofinansowanie stacji. Postępująca degradacja torowisk spowodowana masą pociągów (pociągi wyciągane z KWK Janina), jak i szkodami górniczymi sprawiła mocne ograniczenie prędkości przewozowej. Do 2015 roku przy wjeździe na stację wynosiła 20 km/h, natomiast średnia szlakowa Trzebinia – Czechowice-Dziedzice wynosiła 37 km/h.
Kasę biletową zamknięto w 2004 roku. 2006 rok przyniósł zamknięcie przejścia nad torami, jak również zburzenie magazynów usytuowanych wzdłuż torów rozładowczych. W 2007 PKP PLK oddało wykonawcy remontu przejścia nadziemnego plac na rozpoczęcie robót remontowych. Na początku 2007 roku, ze względu na zły stan techniczny wiaduktu nad trasą Chrzanów – Płaza zamknięto prawy tor szlakowy prowadzący do Chrzanowa i rozpoczęto prace budowlane. Około 12 października oddano do użytku, wcześniej zamknięty, tor numer II. ni „Janina” oraz punkt zdawczo-odbiorczy Kamieniołomu.
W latach 2015–2016 stacja przeszła gruntowną modernizację.