Moduł bazowy od teraz jest rozprowadzany pod licencją GPL, zaś oficjalne rozszerzenie, zawierające wsparcie dla USB 2.0, serwera RDP, oraz PXE, na licencji PUEL. Przebudowa GUI (które jest nazwane od teraz VirtualBox Manager) oraz wzbogacenie go o liczne drobne funkcje. Dodanie obsługi nowego wirtualnego sprzętu (Chipset Intel ICH9 i karta dźwiękowa Intel HD Audio). Usprawnienie obsługi formatu Open Virtualization Format, który jest używany do eksportu oraz importu maszyn wirtualnych. Naprawa błędów znajdujących się w poprzednich wersjach.
VirtualBox 3.2.0 (wydana 2010-05-18) Obsługa nowych procesorów Intela – Core i3, Core i5, Core i7, Xeon 5600. Eksperymentalne wsparcie dla Mac OS X Server. Wirtualny kontroler SAS. Nowy podsystem obsługi I/O dla Storage.
VirtualBox 3.0.0 (wydana 2009-06-30)
Obsługa SMP z użyciem do 32 wirtualnych jednostek obliczeniowych dla procesorów z VT-x i AMD-V. Obsługa OpenGL 2.0 w systemach goszczonych Windows, Linux oraz Solaris. Eksperymentalna obsługa Direct3D 8/9 w systemach goszczonych Windows.