Królestwo było zarządzane odtąd w imieniu władców Aragonii przez wicekrólów Sardynii.
XV-XVII wiek W 1409 r., po ostatecznym pokonaniu Arborei w bitwie pod Sanluri zmarł w Cagliari wnuk Piotra IV, król Sycylii Marcin I, następca tronu Aragonii. Sardynia przeszła wtedy razem ze wszystkimi posiadłościami Aragończyków do kastylijskiej dynastii Trastamara. Następnie przez wiele wieków dzieliła losy Aragonii, stając się częścią korony hiszpańskiej.
W czasach panowania dynastii sabaudzkiej XVIII wiek thumb|upright|Wiktor Amadeusz II W 1708 r., podczas hiszpańskiej wojny sukcesyjnej dostała się pod panowanie austriackie. W 1717 r. Hiszpania jednak ponownie zajęła Sardynię, a w 1718 r. także należącą do Sabaudii Sycylię – co stało się przyczyną utworzenia czwórprzymierza Wielkiej Brytanii, Francji, Austrii i Niderlandów przeciw Hiszpanii, oraz wybuchu hiszpańskiej wojny z koalicją angielsko-francusko-austriacką. W kończącym tę wojnę traktacie w Hadze król Sabaudii Wiktor Amadeusz II zgodził się oddać Sycylię Austrii w zamian za Sardynię.