Ozdobne przeszklenie z licznymi wizerunkami Świętych Pańskich zaprojektował artysta Jan Bukowski z Krakowa w stylistyce młodopolskiej oraz sztuki art déco.
Najcenniejszym elementem wystroju świątyni jest młodopolska polichromia autorstwa Włodzimierza Tetmajera i Henryka Uziembły. Powstała ona w latach 1904–1906. Dekoracja malarska pokrywa powierzchnię 3164 m². Znajduje się na ścianach i sklepieniach naw, transeptu, prezbiterium, przedsionków oraz w zakrystii. Polichromia posiada bogatą i rozbudowaną ikonografię, związaną z wezwaniem kościoła, z historią Polski i Kościoła, wybitnymi postaciami Kościoła oraz licznymi świętymi i błogosławionymi. Uzupełniają ją liczne motywy zdobnicze, oparte na ornamentach roślinnych, głównie kwiatowych, na poły ludowe. W kruchcie znajduje się inskrypcja autorów polichromii.