Obecnie głównymi kierunkami ruchu są: Hare Kryszna (ISKCON), założony przez Bhaktivedantę Swamiego Prabhupadę Sri Chaitanya Saraswat Math założona przez Bhakti Rakszak Śridhar Maharadż Sri Chaitanya Gaudiya Math założona przez Bhakti Dajita Madhawa Maharadża Gaudiya Vedanta Samiti założona przez Bhakti Pradżnana Kesawa Maharadża Sri Gopinath Gaudiya Math założona przez Bhakti Promode Puri Goswami Maharadża Sri Krishna Chaitanya Mission, założona przez Bhakti Waibhawa Puri Goswami Maharadża. Od końca XX wieku za wzorem założyciela ruchu Hare Kryszna, wszystkie te kierunki założyły ośrodki za granicą i obecnie aktywnie propagują gaudija wisznuizm na całym świecie.
Różnice między doktryną gaudija i innymi kierunkami wisznuizmu Chociaż podstawowa doktryna jest identyczna dla wszystkich kierunków, to istnieją różnice. W gaudija wisznuizmie: Kryszna jest uznawany za pierwotną i najwyższą formę Boga (krsnas tu bhagavan svayam), i źródło inkarnacji Wisznu, a nie za jeden z awatarów Wisznu. Radha jest żeńską energią (śakti) Kryszny i źródłem wszystkich innych śakti, w tym Lakszmi i Durgi. Śri Ćajtanja Mahaprabhu jest ostatnią inkarnacją Kryszny w okresie Kalijugi. Kolejna inkarnacja – Kalkin przyjdzie w końcowym okresie juga sandhja.