Od początku lat 90. reprezentacja sześciokrotnie awansowała do finałów mistrzostw Europy (1996, 2004, 2008, 2012, 2016, 2020), oraz siedmiokrotnie do finałów mistrzostw świata (1998, 2002, 2006, 2014, 2018, 2022 i 2026). Największy sukces odniosła na Mundialu 2018 dochodząc do finału i zdobywając srebro. Na Mundialu 1998 z kolei, kiedy drużyna chorwacka prowadzona była przez Miroslava Blaževicia zdobyła ona brązowy medal, a Davor Šuker został królem strzelców turnieju.
Po nieudanym Mundialu 2006 selekcjonerem został ich kolega z brązowej drużyny Slaven Bilić. Nie przeprowadził kadrowej rewolucji, w pierwszej jedenastce wciąż grali najczęściej najbardziej doświadczeni piłkarze. Bilicia broniły jednak wyniki – od sierpnia 2006 do lutego 2007 roku reprezentacja w sześciu spotkaniach nie poniosła ani jednej porażki, a pokonała m.in. mistrzów świata Włochów oraz – w eliminacjach do Euro 2008 – Anglię.
Po nim chorwacką ekipę prowadzili kolejno Igor Štimac, Niko Kovač, Ante Čačić oraz Zlatko Dalić, który zdobył z reprezentacją dwa medale Mistrzostw Świata (srebrny w 2018 i brązowy w 2022), a także srebrny medal Ligi Narodów UEFA w sezonie 2022/2023.