11 grudnia 2016 w kraju odbyło się referendum konstytucyjne, w którym 79,59% głosujących opowiedziało się za zmianami w konstytucji. Głosowano nad zmianami w 30 artykułach obowiązującej konstytucji, ograniczającymi prerogatywy prezydenta na rzecz premiera przy jednoczesnym wzmocnieniu obu tych organów władzy wykonawczej.
Atambajew postanowił wycofać się z drugiej kadencji prezydenckiej i przestrzegać konstytucji, mimo że Putin i Nazarbajew prosili go, aby pozostał u władzy:
„Prezydent Rosji Władimir Putin i prezydent Kazachstanu Nursułtan Nazarbajew poprosili mnie, abym został na drugą kadencję, ale wyjaśniłem, że nie mogę, ponieważ mamy inny naród. Ludzie wybiorą tego, którego uznają za najbardziej godnego”.
Polityka płci Pod przywództwem Almazbeka Atambajewa poczyniono znaczące postępy w zakresie równości płci w Kirgistanie. Wprowadzono 33% parytet reprezentacji kobiet na listach parlamentarnych.