Tolerancja centralna (zwana także tolerancją pierwotną) – zachodzi w centralnych narządach limfatycznych: w grasicy (dotyczy limfocytów T) i w szpiku kostnym oraz w wątrobie płodowej (dotyczy limfocytów B). Proces ten umożliwia usunięcie limfocytów mogących zaszkodzić komórkom organizmu oraz przystosowanie limfocytów do pełnienia przez nie funkcji poprzez wyrobienie zależności od auto-MHC, co skutkuje powstaniem tolerancji immunologicznej dla komórek organizmu.

Los limfocytów Losy progenitorowych komórek limfoidalnych określają receptory Notch.

delecja Notch 1 - blokada rozwoju limfocytów T i prowadzi do ektopii miejsca rozwoju limfocytów B do grasicy ekspresja Notch 1 - prowadzi do rozwoju limfocytów T z progenitorowych komórek limfoidalnych

Selekcja limfocytów T Edukacja limfocytów T Nim limfocyty opuszczą grasicę ulegają bardzo rygorystycznej edukacji.