W 2008 roku Ivanauskas krótko prowadził litewski klub Banga Gorżdy, a następnie pracował z młodzieżowymi reprezentacjami Litwy, kolejno z kadrą U-18 i U-21. W kolejnych latach trenował kluby w różnych krajach: azerski Standard Sumgait, litewski FK Šiauliai, REO Vilnius, gruzińską Dilę Gori, rosyjski SKA-Eniergija Chabarowsk, cypryjski Ethnikos Achna oraz Łucz-Eniergija Władywostok.
We październiku 2018 roku Ivanauskas objął stanowisko trenera Zagłębia Sosnowiec, występującego wówczas w Ekstraklasie. Podpisał roczny kontrakt z opcją przedłużenia w przypadku utrzymania się w lidze. Mimo trudnej sytuacji drużyny na dole tabeli oraz ograniczeń finansowych, Litwin podjął się zadania utrzymania zespołu w najwyższej klasie rozgrywkowej. Pracował tam do końca sezonu 2018/2019. Jeszcze przed zakończeniem rozgrywek poinformował o odejściu z klubu, określając swoją pracę w Sosnowcu jako „najcięższą robotę w karierze”.
W sierpniu 2021 roku Ivanauskas został nowym selekcjonerem seniorskiej reprezentacji Litwy. Kontrakt podpisano do końca eliminacji do Mistrzostw Świata 2022. W pierwszym wywiadzie po nominacji podkreślił potrzebę cierpliwości, zmiany mentalności zawodników oraz zbudowania długoterminowego projektu.