Jezioro jest miejscem rekreacji mieszkańców Warszawy i okolic. Swoją świetność przeżywało w latach 70. XX wieku, gdy wokół powstało wiele ośrodków wypoczynkowych, takich jak m.in. „Kolejarz” i „Energetyk”. Na początku XXI wieku zaniedbane ośrodki wykupywano i przebudowywano według wówczas panujących standardów i w konsekwencji jezioro stało się ponownie atrakcyjne. Ośrodki wypoczynkowe i sportów wodnych zlokalizowane są głównie w takich miejscowościach jak: Nieporęt, Zegrze, Zegrze Południowe, Serock, Zegrzynek, PTTK, Jadwisin – Klub Żeglarski Dolomit, Yacht Klub Jadwisin, Jachranka, Białobrzegi, Rynia.

Czystość wody zbiornika poprawiono dzięki wybudowaniu kilku oczyszczalni nad Narwią, Bugiem i ich dopływami.

Wokół Jeziora Zegrzyńskiego wytyczono dwanaście szlaków rowerowych. Ich łączna długość wynosi 351,1 km.

Wzdłuż Jeziora Zegrzyńskiego znajdują się także licznie „dzikie plaże”, które ze względu na dobre połączenia autobusowe i kolejowe (bezpośrednie połączenia autobusowe z Warszawą liniami 705 i 735, stacje SKM – Nieporęt, Zegrze Południowe, Radzymin, Legionowo) cieszą się sporą popularnością.