Śmierć Po powrocie z USA zamieszkał przy warszawskiej Kanonii. Przez całe życie partner Stefanii Sempołowskiej. Nie pozostawili po sobie dzieci. Zmarł 25 sierpnia 1944 w szpitalu w wyniku ran odniesionych 22 sierpnia od wybuchu bomby podczas bombardowania miasta przez Luftwaffe w trakcie powstania warszawskiego. Pochowany na cmentarzu Powązkowskim (kwatera A-1-1).
W 2022 z inicjatywy premiera Mateusza Morawieckiego grób Stanisława Patka został odrestaurowany. Cały projekt był realizowany przez Fundację Stare Powązki we współpracy z Kancelarią Prezesa Rady Ministrów. mały|Grób Stanisława Patka na Starych Powązkach w Warszawie przed renowacją thumb|Grób Stanisława Patka na Starych Powązkach w Warszawie po renowacji
Ordery i odznaczenia Wielka Wstęga Orderu Odrodzenia Polski (9 listopada 1926)M.P. z 1926 r. nr 259, poz. 725 („za wybitne zasługi na polu dyplomatycznem”). Krzyż Niepodległości (19 grudnia 1930)M.P. z 1930 r. nr 300, poz. 423 („za pracę w dziele odzyskania niepodległości”). Medal Pamiątkowy za Wojnę 1918–1921 Złoty Wawrzyn Akademicki (5 listopada 1935)M.P. z 1935 r. nr 257, poz.