Liczba chromosomów 2n = 48Bidens tripartita na Flora of China [dostęp 2014-01-27]..
Rośnie na glebach mulistych na brzegach wód, zwłaszcza jezior, stawów i większych rzek, ale poza tym rośnie na wszelkich mokradłach i mokrych łąkach, wilgotnych stanowiskach ruderalnych, na przydrożach i przytorzach, rośnie też w uprawach rolnych jako chwast. W klasyfikacji zbiorowisk roślinnych gatunek charakterystyczny dla Cl. Bidentetea tripartiti.
Zmienność Tworzy mieszańce z uczepem śląskim Bidens radiata. Z uczepem amerykańskim Bidens frondosa tworzy mieszańca Bidens × garumnae Jeanj. & Debray. Mieszaniec ten zawiązuje owoce i może występować samodzielnie w oddaleniu od populacji gatunków rodzicielskich. Stwierdzany był w Polsce i innych krajach europejskich.
Nazewnictwo Gatunek ma ustaloną nazwę zwyczajową „uczep trójlistkowy”. Na początku XX wieku w użyciu była także nazwa „uczep dwuzębny”, przywołana później w latach 70. XX wieku przez Jakuba Mowszowicza, który zaproponował także nazwę „uczep trójdzielny”. W XIX wieku i wcześniej roślina nazywa była: „konop' wodna”, „sadziec konopnica”, „strzelec”, „uczep”, „wilk”.