W 2008 roku w niejasnych okolicznościach zginął Szakir al-Abbasi.
W kolejnych latach członkowie grupy uczestniczyli w syryjskiej wojnie domowej, w której poparli przeciwników prezydenta Baszszara al-Asada.
Najważniejsze ataki przeprowadzone przez grupę Fatah al-Islam oskarżony został o przeprowadzenie zamachów bombowych z 13 lutego 2007 roku. Wtedy to terroryści zaatakowali dwa autobusy w chrześcijańskiej enklawie nieopodal miasta Bikfajja. W atakach zginęły trzy osoby.
11 czerwca 2007 roku islamiści ostrzelali z moździerzy pojazd Czerwonego Krzyża. Śmierć odniosły 2 osoby, a jedna została ranna.
24 czerwca 2007 roku organizacja przeprowadziła zamach bombowy na oddział ONZ w południowym Libanie. Zginęło 6 osób, a jedna została ranna.
13 maja 2008 roku grupa przyznała się do zamachu bombowego w Abdeh, w którym zginęła jedna osoba.
Islamiści przyznali się do ostrzału rakietowego izraelskich osadników w miejscowości Meftahim w dniu 25 maja 2008 roku.
Grupa oskarżona została o przeprowadzenie zamachu bombowego na autobus w Trypolisie w dniu 13 sierpnia 2008 roku.
Radykałowie przyznali się do zamachu z użyciem samochodu pułapki w Damaszku, który miał miejsce 27 września 2008 roku. W ataku zginęło 17 osób.