Premier i przewodniczący parlamentu Prezydent Mamadou Tandja 3 czerwca 2007 mianował go nowym szefem rządu, wybierając jego osobę spośród trzech kandydatur zaproponowanych przez parlament. Nominacja Oumarou spotkała się z ostrym sprzeciwem opozycji oraz organizacji społecznych, podkreślających jego bliskie związki z byłym premierem. Seyni Oumarou został zaprzysiężony na stanowisku premiera 7 czerwca 2007.
18 sierpnia 2009, po wprowadzeniu zmian do konstytucji, premier Oumarou podał swój rząd do dymisji. Jednak już następnego dnia prezydent Tandja ponownie mianował go na stanowisko szefa rządu oraz powołał nowy gabinet w niezmienionym składzie. Gabinet ten, choć identyczny, zgodnie z nowelizacją ustawy zasadniczej, utracił część swych uprawnień na rzecz prezydenta. 20 sierpnia 2009 prezydent wyznaczył datę wyborów parlamentarnych na 20 października 2009.
23 września 2009 premier Oumarou, razem z dwoma innymi ministrami, zrezygnował ze stanowiska szefa rządu. Jak wyjaśnił, powodem tej decyzji był start w październikowych wyborach parlamentarnych. Funkcję tymczasowego premiera objął dotychczasowy minister spraw wewnętrznych, Albadé Abouba.
W wyborach parlamentarnych 20 października 2009 uzyskał mandat deputowanego. 25 listopada 2009 został jednogłośnie wybrany przewodniczącym Zgromadzenia Narodowego.