Premier thumb|280px|Salam Fajjad i MSZ Izraela Cippi Liwni w czasie Światowego Forum Ekonomicznego w Davos, 2008. Po zerwaniu koalicji przez oba ugrupowania, prezydent Mahmud Abbas wprowadził stan wyjątkowy oraz 15 czerwca 2007 mianował Fajjada nowym premierem Autonomii Palestyńskiej"Abbas appoints new Palestinian PM", BBC News, 15 czerwca 2007.. Isma’il Hanijja nie uznał tego kroku i nadal uważał się za premiera. Oskarżył prezydenta Abbasa o złamanie prawa i uznał rząd Fajjada za niekonstytucyjny, gdyż nie otrzymał on zatwierdzenia przez Radę Legislacyjną Autonomii Palestyńskiej (w której większość głosów posiadał Hamas)"Whose Coup, Exactly?", The Electronic Intifada, 18 czerwca 2007.. W Autonomii Palestyńskiej rozpoczął się od tego czasu de facto okres dwuwładzy.
7 marca 2009 premier Fajjad przedłożył swoją rezygnację prezydentowi Mahmudowi Abbasowi. Nastąpiło to w przededniu wspólnych rozmów Fatahu z Hamasem w Kairze. Efektem negocjacji, prowadzonych pod patronatem Egiptu, miało być porozumienie dwóch skłóconych frakcji w sprawie przeprowadzenia wyborów prezydenckich i parlamentarnych w styczniu 2010 oraz utworzenia wspólnego rządu jedności narodowej"Palestinian PM Fayyad steps down", BBC News, 7 marca 2009..