26 lutego 1833 roku utworzono oficjalnie hrabstwo Iroquois

Obecne granice hrabstwa zostały ostatecznie utworzone w 1853 roku kiedy to z wydzielonych terenów hrabstwa Iroquois i Will utworzono hrabstwo Kankakee.

Pierwszą siedzibą władz lokalnych od 1835 było miasto Montgomery, jednakże z powodu nie zadowolenia z lokalizacji siedziby w 1839 roku siedzibę przeniesiono do Middleport.

Pierwszym lokalnym budynkiem było więzienie. W 1843 roku rozpoczęto budowę budynku sądu a w 1847 oddano do użytku.

Ważniejszymi postaciami w historii hrabstwa pochodzenia z plemienia Irokezów byli: Henry Bacon, urodzony w 1866 roku w Watseka, architekt pomnika Lincolna w Waszyngtonie oraz kilku użyteczności publicznej; Fern Andre, urodzona w 1893 roku w Watseka, aktorka filmowa w latach 1913–1930; Rex Everhart, urodzony w 1920 roku w Watseka, aktor Teatru broadwayowskiego znany z roli Maurice w filmie Disneya Piękna i Bestia.