Więzienie Po powrocie do RPA w 1976 Sexwale został schwytany przez południowoafrykańskie siły bezpieczeństwa. Razem z 11 innymi osobami, po ponad dwuletnim procesie w Sądzie Najwyższym w Pretorii, został oskarżony o terroryzm i konspirację w celu obalenia prawowitego rządu. Został wysłany do najbardziej strzeżonego więzienia, na Wyspę Robben, z wyrokiem 18 lat. Jego współwięźniem był m.in. Nelson Mandela. Został zwolniony po 13 latach, w czerwcu 1990, po zawarciu porozumienia przez Afrykański Kongres Narodowy i Partię Narodową.
Kariera polityczna Po zwolnieniu z więzienia Sexwale powrócił do Johannesburga, gdzie stanął na czele Departamentu Współpracy ANC. W 1991 został przewodniczącym ANC w regionie Pretoria-Witwatersrand-Vereeniging (PWV) i pozycję tę zajmował do 1997.
Po pierwszych wolnych wyborach prezydenckich w Południowej Afryce w 1994 Sexwale został premierem prowincji PWV. Z polityki zrezygnował w 1998. Powody tej decyzji nie są do końca wyjaśnione.