Wydział I – Komendantura (Kommandantur) Wydział I składający się z kilku komórek organizacyjnych odgrywał rolę sztabu komendanta obozu. Kierownikiem tego wydziału był adiutant. Prowadził on kancelarię komendanta obozu Stutthof. Przez jego ręce przechodziła cała korespondencja przychodząca i wychodząca z obozu, wiele pism podpisywał w imieniu lub z upoważnienia komendanta. Przygotowywał codzienne raporty dla komendanta o wydarzeniach w obozie, opracowywał zarządzenia i rozkazy oraz czuwał nad ich prawidłową realizacją. Adiutantowi podlegał cały personel I i VI wydziału.
mały|Budynek komendantury mały|Jenny-Wanda Barkmann wśród żeńskiego personelu obozowego – SS-Aufseherin z obozu Stutthof (KL) – w powojennym procesie w 1946 w Gdańsku
Adiutantami w Stutthofie byli: SS-Obersturmführer Erich Müller (od stycznia 1942 do 14 grudnia 1943) SS-Untersturmführer Walter Unger (od 15 grudnia 1943 do 15 czerwca 1944) SS-Oberscharführer Josef Stahl (od 15 czerwca 1944 do 4 kwietnia 1945)
W skład wydziału wchodziły komórki organizacyjne: