Ostatecznie MKS zakończył rundę jesienną w III lidze na 3. pozycji.

Przed rundą wiosenną nastąpiły w klubie kolejne zmiany, na czele zarządu stanął Bolesław Bednarczuk, a do kadry dołączyli: Kamil Nitkiewicz (z Chrobrego Głogów), Paweł Gierak (z Motoru Praszka), bramkarz Marcin Mazur (z Pogoni Kostów). Natomiast z gry na Cyprze wrócił Bartosz Szepeta. Z klubu odszedł do Odry Opole Grodzki. Jeszcze przed zakończeniem sezonu zapadła decyzja, że w nowym sezonie zespołu nie poprowadzi duet trenerski – Okaj, Płaczkowski. Funkcję szkoleniowca od dnia 1 lipca 2008 roku przejął Andrzej Polak, który dotychczas był trenerem Victorii Chróścice. W rundzie wiosennej MKS rozegrał 15 spotkań, w tym 8 razy zwyciężał, 3 razy remisował i 4 mecze przegrał. Ostatecznie sezon 2007/2008 MKS zakończył na 4 miejscu i awansował do II ligi.

Sezon 2008/2009 – II liga W sezonie 2008/2009 prezesem klubu był Bolesław Bednarczuk, wiceprezesami Wojciech Smolnik, Roman Kamiński i Adam Stecki, trenerem Andrzej Polak, jego asystentem Andrzej Konwiński, trenerem bramkarzy Piotr Gucz, masażystką Małgorzata Derda, a kierownikiem drużyny