Drużynę opuścili Gacek, Panek, Folarin, Smotrycki, Mostowy, Gumny, Miś, Żymańczyk i Hrywna.
Runda wiosenna była dla MKS-u bardzo udana, w pierwszych dwunastu kolejkach nie zanotował żadnej porażki (9 zwycięstw i 3 remisy), strzelając w nich 25 bramek, a tracąc jedynie 3. Swoją siłę kluczborska drużyna pokazała m.in. w meczu z wiceliderem – Swornicą Czarnowąsy – wygrywając w Czarnowąsach 2:0. W 13. kolejce passę tę przerwał dopiero OKS Olesno, zwyciężając u siebie 1:0. Jednak w następnym meczu rozgrywanym w Kluczborku z Małąpanwią Ozimek, MKS wygrał aż 7:1 awansując na 3. miejsce w IV-ligowej tabeli. W przedostatniej kolejce rundy wiosennej, po wygranej 2:1 z Motorem Praszka, MKS Kluczbork został wiceliderem, lecz w ostatniej przegrał 0:2 na boisku lidera – Skalnika Gracze – i ostatecznie zakończył zmagania w lidze na 4 miejscu, mając tyle samo punktów co drugi i trzeci zespółIV liga, sezon 2004/2005..
Sezon 2005-2006 i 2006-2007 – IV liga Przed rozpoczęciem sezonu 2005/2006 na stanowisko prezesa klubu został wybrany Norbert Wolf, natomiast funkcję trenera objął Ryszard Okaj.