W latach 60. przez cztery lata była związana z Zdenkiem Rytirem. W latach 1969–1975 była związana z Ludkiem Švábenskym, muzykiem zespołu Stryci. 28 kwietnia 1983 poślubiła niemieckiego gitarzystę basowego , z którym w 2001 się rozwiodła. W lutym 2003 wyszła za przedsiębiorcę Martina Michala, który został jej menedżerem. Jest bezdzietna.
Utrzymuje przyjacielskie kontakty z polską piosenkarką Marylą Rodowicz.
Dyskografia Albumy solowe Rok Tytuł Wytwórnia 1969 Růže kvetou dál Supraphon 1970 Ostrov Heleny Vondráčkové Supraphon 1971 Isle of Helena Supraphon & Aritia 1972 Helena! Helena! Helena! Supraphon Helena'72 Nippon Columbia 1974 Helena a Strýci Supraphon 1975 Film Melodies Supraphon & Aritia 1976 Immortal film themes Nippon Columbia 1977 S písní vstříc ti běžím Supraphon 1978 Unter der Asche meiner Liebe ist noch Glut Teldec & Telefunken & Decca Paprsky Supraphon 1979 Unter der Asche meiner Liebe ist noch Glut Amiga Doch in der Nacht Teldec & Telefunken & Decca 1980 Golden Movie Hits Music Supraphon & Aritia Múzy Supraphon 1981 Písně Billyho Joela Supraphon Helena Singt Billy Joel Supraphon & Teldec Sblížení Supraphon 1982 A ty se ptáš, co já...