20 sierpnia 2007 pokonał w prawyborach Park Geun-hye, uzyskując nominację swojej partii.
Krótko przed wyborami prezydenckimi przeciw Lee pojawiły się zarzuty, oskarżające go o działania korupcyjne w 2001. 3 grudnia 2007 prokuratura stwierdziła jednak, że nie dysponuje żadnymi dowodami przeciw niemuS Korea candidate in fraud denial, BBC News, 18 grudnia 2007..
Jego program prezydencki zawierał się w tzw. Planie 747 (nawiązanie do cech samolotu Boeing 747), który przewidywał utrzymanie przez Republikę Korei corocznego 7% wzrostu PKB, osiągnięcie poziomu PKB równoważnemu 40 tysiącom USD na 1 mieszkańca i uczynienie kraju siódmą gospodarką świata podczas pełnienia urzędu przez jego osobę, The Sejong Society.. Zapowiedział także budowę Wielkiego Koreańskiego Szlaku Wodnego (kanał), ciągnącego się od Pusanu do Seulu.
W sprawie Korei Północnej głosił potrzebę powiązania jej z Koreą Południową poprzez wzajemne relacje gospodarcze. Zapowiedział zwiększenie inwestycji gospodarczych u północnego sąsiada, powołanie konsultacyjnego komitetu ds. gospodarczych, a w przyszłości ustanowienie Koreańskiej Wspólnoty Gospodarczej, english.chosun.com, 11 września 2007..