Klasyfikacja Pozycja systematyczna sigilmassazaura jest niepewna, z całą pewnością jest on jednak tetanurem. Russel w 1996 stworzył dla owego dinozaura i jego krewnych rodzinę Sigilmassasauridae. Niektórzy badacze negują ważność rodzaju Sigilmassasaurus. Paul Sereno opisali czaszkę (SGM-Din- 1) i kręg szyjny (SGM-Din- 3) podobny do tego u „spinozaura B”. Przez to uznali go za synonim karcharondontozaura. Później poszli jeszcze dalej; uznali sigilmassauraara za synonim karcharodontozaura (Sereno i inni, 1988). Później okazało się jednak, że kręg na podstawie którego Sereno zsynonimizował „spinozaura B” i karcharodontozaura nie został powiązany z czaszką, a sama ona różni się pod niektórymi względami od czaszki z holotypu karcharodontozaur. „Spinozaur B” różni się od karcharodontozaurami niektórymi cechami, więc obecnie najczęściej uznaje się sigilmassazaura za rodzaj różny od karcharodontozaura.