Samuel Johnson (ur. 25 lipca 1973 w Akrze) – ghański piłkarz grający na pozycji defensywnego pomocnika.
Kariera klubowa Johnson był wychowankiem klubu Hearts of Oak wywodzącego się z jego rodzinnego miasta, Akry. W drużynie tej zadebiutował w 1991 roku w rozgrywkach ligi ghańskiej. Swój pierwszy i jedyny sukces z tym klubem osiągnął w 1994 roku, gdy wywalczył Puchar Ghany.
Latem 1995 roku Johnson wyjechał do Europy i został zawodnikiem greckiego klubu PAE Kalamata. Przez rok występował w rozgrywkach Alpha Ethniki, a następnie przeszedł do Anderlechtu, w którym spotkał swojego rodaka Yaw Preko. Trafił jednak na słabszy okres klubu i nie osiągnął większych sukcesów, a przez dwa sezony wystąpił w 37 meczach i strzelił 2 gole.
W 1998 Johnson przeniósł się do Turcji i wraz z Preko trafił do Gaziantepsporu. Zespół zajął 7. miejsce w tureckiej ekstraklasie, ale obaj Ghańczycy należeli do najlepszych zawodników zespołu, a ich postawa nie przeszła niezauważona przez trenera Fenerbahçe SK, Zdenka Zemana, który sprowadził obu zawodników do Stambułu. Już w 2001 roku Samuel wywalczył mistrzostwo Turcji, a w sezonie 2001/2002 wystąpił w fazie grupowej Ligi Mistrzów, ale Fenerbahçe przegrało w niej wszystkie 6 spotkań, a w lidze nie obroniło tytułu i zostało wicemistrzem kraju.