27 kwietnia 2005 został dziekanem kolegium kardynalskiego i trzy dni później otrzymał związaną z tym stanowiskiem podmiejską diecezję Ostii (kardynałem biskupem Ostii był przed wyborem na papieża Joseph Ratzinger).
22 czerwca 2006 papież Benedykt XVI przyjął rezygnację kard. Sodana z funkcji sekretarza stanu (złożoną ze względu na podeszły wiek) i mianował na jego miejsce kard. Tarcisia Bertonego, który objął nowy urząd 15 września 2006. 23 listopada 2007 w związku z ukończeniem 80. roku życia utracił prawo do czynnego udziału w przyszłym konklawe.
18 kwietnia 2010 jako osobisty wysłannik papieża Benedykta XVI miał przewodniczyć uroczystościom pogrzebowym polskiej pary prezydenckiej Lecha i Marii Kaczyńskich. Jednak jego przylot został odwołany z powodu obecności wulkanicznego pyłu nad Europą.
21 grudnia 2019 papież Franciszek przyjął jego rezygnację z urzędu dziekana Kolegium Kardynalskiego. Od tej chwili kardynałowi Sodano przysługiwał honorowy tytuł emerytowanego dziekana Kolegium Kardynalskiego. Jego następca – kard. Giovanni Battista Re – został wybrany po raz pierwszy według nowych zasad na 5-letnią kadencję z możliwością jej przedłużenia.