Spór o nowy klub w AFL Gdy SANFL ostatecznie zgodził się na wprowadzenie swojej drużyny do ligi AFL, zaczęto debatować kto do niej przystąpi. SANFL chciał aby do AFL przystąpił całkowicie nowy klub, który byłby reprezentantem całego stanu i ligi stanowej. Z przyczyn oczywistych Port Adelaide FC nie chciał przystać na taką propozycję, co skończyło się wojną ze stanową centralą. Ostatecznie „zielone światło” udzielono SANFL (AFL nie chciała wchodzić w konflikt z organizacją słynącą z separatyzmu) i utworzono Adelaide FC.

Po tych sporach, Port Adelaide FC zaczął być negatywnie odbierany przez większość klubów stanowych. Wielu wpływowych działaczy żądało wręcz wykluczenia klubu z rozgrywek stanowych, co się jednak nie stało (SANFL widząc olbrzymią popularność klubu do tego nie mógł dopuścić).

Wstąpienie do AFL W połowie lat 90. XX wieku, kluby AFL: Brisbane FC i Fitzroy FC uzgodniły warunki fuzji, przez co zwolniło się miejsce dla jednego klubu. Port Adelaide FC stał się głównym kandydatem, i w ostateczności otrzymał koncesję na grę w tej lidze. Zespół zadebiutował w AFL w 1997 roku.