Śmierć 25 stycznia 1945 roku ksiądz Jan Freznzel został zatrzymany przez żołnierzy z 118 Korpusu pod dowództwem gen. maj. A. Naumanowa podczas udzielania w piwnicy przy ulicy Kubotha 13 wiatyku postrzelonemu przez wkraczające do Miechowic oddziały Armii Czerwonej Huberowi Drzysga. Następnie uprowadzony do Stolarzowic, gdzie znajdowała się tymczasowa siedziba generała. W drodze do bunkra dowodzenia oraz w trakcie przesłuchania bestialsko torturowany, a następnie zamordowany. Jako dzień śmierci przyjęto datę 26 stycznia 1945 roku. Ciało księdza Jana Frenzla pochowano 3 lutego 1945 roku na parafialnym cmentarzu w Stolarzowicach, poza zbiorową mogiłą mieszkańców pomordowanych podczas zdobywania miejscowości. Na prośbę rodziny ponownego pochówku dokonano 9 lutego 1945 roku na cmentarzu w Brzezinach Śląskich.
Upamiętnienie Nazwiskiem księdza Jana Frenzla nazwano główną ulicę dzielnicy Miechowic (Droga Krajowa nr 94 na odcinku od skrzyżowania z ulicą Jana Nowaka Jeziorańskiego do granicy miasta) i Piekar Śląskich (Droga Krajowa nr 94 na odcinku od skrzyżowania z ulicą bpa Herberta