Kolejne wydanie studyjne Mother Of Disease (przez krytyków uważany za najlepszy krążek ich twórców) utrzymane zostało w dotychczasowym klimacie znanym z wcześniejszego albumu. Zatem znaleźć można tu dalej motywy militarne, partie na bębnach i neoklasyczne motywy. Mini-album Hail The Mushroom Cloud, który powstał niedawno po wcześniejszym albumie, jest bardziej stonowany i dedykowano go wynalazkowi, który wywarł znaczący wpływ na XX wiek – bombie atomowej. Rok 1999 przyniósł wydanie War On. Składały się nań utwory z lat wcześniejszym, poddane nowej aranżacji oraz dwa premierowe. Ujrzenie światła dziennego przez album Total Cleansing oraz single Genocidal i A Call to Arms było zapowiedzią zmiany stylu zespołu. Total Cleansing jest bardzo stonowany w porównaniu ze wcześniejszymi osiągnięciami i bardziej przypomina Hail The Mushroom Cloud. Nie zatracił pomimo tego zabiegu Puissance swoich charakterystycznych elementów nie zatracił. Pesymizm jest nadal wyczuwalny. Tą samą linię utrzymywano w wydanym w 2004 r. studyjnym albumie State Collapse. W 2007 wydany został Grace Of God.
W czasie swojej kariery duet dawał koncerty m.in. na Cold Meat Industry Festival w Erlangen, 7 sierpnia 1999 w Oelsnitz/Erzgeb. (oba miasta w Niemczech).