Rodzeństwo kompozytora nie zostało dotychczas ustalone.
Józef Zeidler ożenił się około 1770 roku w Święciechowie z Barbarą Schlabs, córką miejscowego rzeźnika, Andrzeja i Rozalii. Mieli co najmniej ośmioro dzieci. Był kantorem w miejscowym kościele pw. św. Jakuba Większego Apostoła. Pełnił też funkcję pisarza miejskiego. Był również dzierżawcą wsi Szczodrochowo, położonej w odległości około 6 km od Gostynia, w latach 1794-1798. Wieś Szczodrochowo, jak i miasto Święciechowa, stanowiły własność opactwa benedyktynów w Lubiniu. Oprócz tego, że kompozytor pełnił funkcję dzierżawcy wsi Szczodrochowo, wiadomo także, że użytkował inne domeny lub domenę, jednak trudno wskazać właściwą miejscowość. Zajęcia te sprzyjały Zeidlerowi w odbywaniu podróży po części południowo-zachodniej Wielkopolski. U schyłku XVIII wieku osiadł w Gostyniu, gdzie zamieszkała też z rodziną jego córka Marianna Anna Małgorzata, żona Ignacego Łopińskiego, zamożnego kupca i dzierżawcy pochodzącego z Poznania. Ich córka Franciszka (1801-1887), była żoną znanego burmistrza Gostynia, kapitana wojsk napoleońskich Jana Macieja Kuleszy. Pozostałe dzieci Józefa Zeidlera mieszkały m.in. w takich miejscowościach jak Poznań, Rawicz czy Zduny.