W maju 2025 Michał Bilewicz został skrytykowany za porównanie wyborców kandydata na Prezydenta RP Karola Nawrockiego do wyboru moralnego w Jedwabnem — sugerując, że głosowanie na Nawrockiego oznacza „stanąć po stronie podpalaczy stodoły”.

Sprawa nadania tytułu profesora Wniosek o nadanie tytułu profesora Michałowi Bilewiczowi był blokowany przez prezydenta od początku 2019; sprawę monitorował Rzecznik Praw Obywatelskich. W wyroku z 15 października 2024 Naczelny Sąd Administracyjny oddalił skargę kasacyjną prezydenta Andrzeja Dudy, zobowiązując go do rozpatrzenia wniosku o nadanie Michałowi Bilewiczowi tytułu profesora w ciągu miesiąca od otrzymania wyroku. W maju 2025 prezydent Andrzej Duda w Kanale Zero stwierdził, że Michał Bilewicz realizuje „wątpliwą naukowo działalność”, „prowadzi działalność antypolską, oczernia Polskę i Polaków”. W lipcu 2025 do Andrzeja Dudy wystosowany został list otwarty, który został przyjęty jako uchwała Komitetu Psychologii Polskiej Akademii Nauk, i pod którym podpisało się ponad sześćset osób – naukowców – z apelem „o powstrzymanie się od dalszych wypowiedzi deprecjonujących naukowców” i stwierdzeniem, że wypowiedź prezydenta „podważyła zaufanie do uczciwości postępowania recenzyjnego”.