thumb|Szyny z czasów I wojny światowej na stacji Poniatowa W 1990 kolejka zatrudniała 253 pracowników. Po 1989 przewozy towarowe i pasażerskie zaczęły gwałtownie spadać. W 1991 przestały kurować pociągi pasażerskie do Poniatowej, a cztery lata później zlikwidowano ostatnie stałe połączenie pasażerskie do Opola Lubelskiego. Wprowadzono za to specjalne pociągi turystyczne. W 1994 roku przewieziono 3400 osób w 35 pociągach turystycznych, w 1998 roku 17 063 osób w 187 pociągach. W 1998 roku przewieziono też 15 tysięcy ton towarów, głównie miału węglowego. Kolej jednak wciąż przynosiła straty i z końcem roku 2001 PKP całkowicie zaprzestało ruchu. Dodatkowo, w 1999 roku samochód ciężarowy uszkodził wiadukt w Rogalowie. Ciągłe zmiany w lokalizacji trakcji spowodowały, że na przykład na stacji w Poniatowej wykorzystano szyny z różnych okresów i kilkunastu wytwórców z wielu państw: carskiej Rosji, Niemiec, Czech, USA i Węgier, w tym Lackawanna Steel Company, Maryland Steel Company, z zakładów Bochumer Verein i Diósgyőr.