W styczniu 2015 został członkiem Rady Gospodarczej przy prezesie Rady Ministrów, a w lutym 2015 szefem Zespołu Doradców Politycznych Prezesa Rady Ministrów. Był jedną z osób, których prywatne rozmowy zostały nagrane i następnie ujawnione w ramach tzw. afery podsłuchowej. W jej trakcie w czerwcu 2015 premier Ewa Kopacz przyjęła jego dymisję. Jacek Rostowski zrezygnował również z ubiegania się o poselską reelekcję. W 2016 został członkiem zespołu doradców ekonomicznych PO, odchodząc z zarządu krajowego partii.
W 2019 kandydował w Wielkiej Brytanii w wyborach europejskich z listy partii , która nie uzyskała żadnych mandatów w PE. W styczniu 2025 został p.o. kierownika Stałego Przedstawicielstwa RP przy Organizacji Współpracy Gospodarczej i Rozwoju (OECD) w Paryżu. W kwietniu tego samego roku prezydent mianował go na stanowisko stałego przedstawiciela RP przy OECD Postanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 11 kwietnia 2025 r. nr 110.5.2025 w sprawie mianowania Ambasadora Rzeczypospolitej Polskiej ()..