0:5 Coras 44, 0:6 Lais 79, 1:6 Gauci 90 SSC Napoli – PAOK FC 1:0 i 1:1 1 07.09 1988 1:0 Maradona 58k 2 06.10 1988 1:0 Careca 17, 1:1 Skartados 65 FK Partizan – Sławia Sofia 5:0 i 5:0 1 07.09 1988 1:0 Batrović 7, 2:0 Batrović 29, 3:0 V. Djukić 46, 4:0 Vokri 68, 5:0 M. Djukić 89 2 05.10 1988 1:0 Vokri 48, 2:0 Djordjević 51, 3:0 Grekow 73s, 4:0 M. Djukić 80, 5:0 V. Djukić 89 Servette FC – SK Sturm Graz 1:0 i 0:0 1 07.09 1988 1:0 Grossenbacher 89 2 05.10 1988 Trakija Płowdiw – Dynama Mińsk 1:2 i 0:0 1 07.09 1988 0:1 Kondratiew 44, 0:2 Gocmanow 80, 1:2 Zajcew 88k 2 05.10 1988 Beşiktaş JK – Dinamo Zagrzeb 1:0 i 0:2 1 07.09 1988 1:0 Feyyaz 4 2 05.10 1988 0:1 Radmilo Mihajlović 40, 0:2 Radmilo Mihajlović 65
1/16 finału Bayern Monachium – DAC Dunajská Streda 3:1 i 2:0 1 26.10 1988 1:0 Flick 21, 2:0 Wegman 53, 3:0 Thon 77, 3:1 Szaban 78 2 09.11 1988 1:0 Thon 4k, 2:0 Thon 28 1. FC Köln – Rangers 2:0 i 1:1 1 26.10 1988 1:0 Janssen 77, 2:0 T.