łodygi są czerwono lub fioletowo nabiegłe. Poza tym rośliny tego gatunku są aromatyczne, podczas gdy rzepień pospolity jest bezwonny.
Biologia i ekologia Roślina jednoroczna. Kwitnie od lipca do października.
Rośnie często na glebach kamienistych i piaszczystych. Zajmuje siedliska ruderalne: tereny kolejowe, przydroża, nieużytki, rumowiska, rośnie także jako chwast w ogrodach, rzadziej niż rzepień włoski rośnie na brzegach rzek. W klasyfikacji zbiorowisk roślinnych gatunek charakterystyczny dla Ass. Xanthietum strumarii.
Roślina trująca Szczególnie toksyczne są nasiona i rośliny w początkowej fazie wzrostu. Zawierają one m.in. ksantyninę, alkaloidy i glikozyd ksantostrumarynę. Trujące są dla bydła domowego, owiec, kur, a szczególnie dla młodych świń. Objawy występują szybko po spożyciu roślin w postaci: nudności, wymiotów, osłabienia akcji serca, spadku temperatury, czasem drgawek i w końcu śmierci.
Zmienność Tworzy mieszańce z rzepieniem włoskim.