Po powrocie ze swej pełnej przygód wyprawy jest on już zupełnie innym człowiekiem.
Historia Po tym jak przypadkowo zabija jednego z dwóch agentów rządowych, którzy wtargnęli nielegalnie do jego domu w poszukiwaniu listów wysyłanych przez jego ojca (w których to ponoć miały być zawarte tajne informacje), Will pozostawia swoją matkę w bezpiecznym miejscu pod opieką byłej nauczycielki gry na pianinie, a sam wyrusza w poszukiwaniu ojca, w którego odnalezieniu widzi rozwiązanie wszelkich problemów. Wędrując trafia przez przypadek na wrota do innego wymiaru - Cittàgazze - w którym poznaje Lyrę Belacqua. Dziewczynka trafiła tam podążając za swoim ojcem, Lordem Asrielem, przez utworzone przez niego wrota, w celu znalezienia informacji o Pyle.
Od tego momentu dzieci podróżują razem poszukując informacji o Pyle i ojcu Willa uzbrojeni w Magiczny nóż zdobyty podczas pobytu w Cittàgazze (w czasie zdobywania którego chłopiec stracił dwa palce prawej ręki - mały i serdeczny). Ostatecznie udaje się spełnić wszystkie wyznaczone cele - Lyra dowiaduje się interesujących rzeczy na temat Cząsteczek Rusakowa, a Will odnajduje swojego ojca - Johna Parry - który od czasu swego zaginięcia uwięziony był w świecie Lyry bez możliwości powrotu.