Inne stanowiska oraz członkostwa w organizacjach Członek rady nadzorczej ZDF Przewodniczący rady Bawarskiej Fundacji Krajowej Przewodniczący rady Bawarskiej Fundacji Nauki Przewodniczący zgromadzenia doradczego FC Bayern München e.V. Przewodniczący rady Fundacji Sudeckoniemieckiej Przewodniczący rady Fundacji Buchheima Członek: SpVgg Unterhaching, TSV 1860 Monachium e. V., Eis Club „Die Löwen” Bad Tölz e. V., Kompanii strzelców górskich Wolfratshausen, Parsberger Schützen Alling, Trachtenverein „D’Loisachtaler”, Okręgowego Związku Wędkarskiego Wolfratshausen Honorowy członek katolickiego Związku Studentów D.D.St.V. Trifels München Wydawca „Kuriera Bawarii”, tygodnika CSU Członek Stowarzyszenia przeciwko oszukańczemu wyszynkowi (dosł. nalewaniu) Ambasador Mistrzostw Świata w piłce nożnej osób niepełnosprawnych
Kontrowersje Edmund Stoiber jest znany z poparcia dla środowisk związanych z ruchem wypędzonych, czyli Niemców wysiedlonych po II wojnie światowej. Wielokrotnie przemawiał na ich zgromadzeniach. W jednym z nich, dokonanym 23 czerwca 2002 roku wyraził opinię iż „Niemcy posiadają bogatą kulturę i historię a Wschodnie Prusy nieodłącznie należą do nich”.