Zmiany Większość utworów w Silent Hill 3 HD zostały na nowo nagrane lub zmienione całkowicie. W Silent Hill 3 HD dokonano dwóch zmian w dialogach. Pierwszy to tekst Claudii gdy pierwszy raz spotyka Heather: „They've come to witness the Beginning. The rebirth of Paradise, unspoiled by mankind” (wcześniej powiedziała despoiled, lecz zmiana ta fabularnie nie ma sensu). Druga to: „I'll kill you, you bitch!” zamiast „I'll get you for this!”, w momencie, gdy Heather odkrywa, że Claudia przyczyniła się do śmierci jej ojca. Zmiany te jednak dotyczą tylko w głosach – wyświetlane napisy pokazują oryginalne dialogi, co musiało być przeoczone przez developerów. Jeremy Blaustein, autor oryginalnych dialogów, zaakceptował te zmiany. Gdy Heather odkrywa rannego Douglasa, jego płaszcz jest dużo bardziej krwawy niż w oryginale. W HD Collection ciało martwego Harry’ego na fotelu pokazane jest w całości. W oryginale we wszystkich scenach pokazywano jego ciało bez głowy.