W ciągu dwóch miesięcy (czerwiec–lipiec 1940) rozwiązano większość estońskich organizacji społecznych, w tym także Estońską Akademię Nauk, zarządzono nowe wybory do parlamentu (wygrane przez komunistyczny komitet wyborczy Związek Ludu Pracującego Estonii – w jego skład wchodziła Komunistyczna Partia Estonii), który zainaugurował obrady 21 lipca 1940J. Lewandowski, Historia Estonii, Wrocław 2002, s. 186, 217; R.J. Misiunas, R. Taagepera, The Baltic States. Years of Dependence 1940-1980, Berkeley–Los Angeles 1983, s. 22; Vares Johannes, [w:] Nowa Encyklopedia Powszechna PWN, t. 6, Warszawa 1997, s. 602; Vares Johannes, [w:] Popularna Encyklopedia Powszechna, t. 11, Kraków–Warszawa 2002, s. 634; Vares Johannes, [w:] Wielka Encyklopedia PWN, t. 28, Warszawa 2005, s. 422..
Działalność polityczna w Estońskiej Socjalistycznej Republice Radzieckiej Po proklamowaniu powstania Estońskiej Socjalistycznej Republiki Radzieckiej Vares został mianowany jej prezydentem w miejsce Pätsa, a po uchwaleniu nowej konstytucji (25 sierpnia 1940), już po wejściu Estonii w skład Związku Socjalistycznych Republik Radzieckich Vares został przez parlament (konstytucyjną Radę Najwyższą) wybrany na przewodniczącego prezydium tejże.