Sierżant spotyka Morrisona, uwięzionego przez Wojowników Nocy. Morrison ujawnia, że najemnicy obecnie usiłują zdobyć próbkę DNA Almy, znajdującej się w placówce klonowania. Po uwolnieniu przez sierżanta, Morrison prowadzi go krótszą drogą. Morrison wprowadza sierżanta do placówki i natychmiast zostaje zabity przez Almę. Sierżant porusza się po placówce, okazjonalnie trafiając na Fettela i jego tajemnicze komentarze na temat Projektów Pochodzenie i Perseusz, pierwszego „” oraz a. Przywódca najemników dociera pierwszy do DNA lecz sierżant nie daje za wygraną i po pościgu stacza zwycięski pojedynek. Następnie sierżant spotyka się z em i obydwaj dostają się do śmigłowca ewakuacyjnego. W chwili rozpoczęcia lotu sierżant doświadcza wizji a, który – w przeciwieństwie do wcześniejszych halucynacji – wygląda na spokojnego. Drużyna bezpiecznie opuszcza teren, a awansuje sierżanta na stopień porucznika.
Po napisach końcowych następuje odtworzenie nagrania Wojowników Nocy odnajdujących ciało Morrisona. Jeden z najemników dostarcza senatorowi próbkę DNA Fettela, co potwierdza że F.E.A.R. jest w posiadaniu DNA Almy.