Powierzono mu funkcję pilota misji STS-126Komunikat NASA o zmianie w składzie załogi STS-126. 15–30 listopada 2008 – na pokładzie wahadłowca Endeavour uczestniczył w misji STS-126. 24 lutego – 9 marca 2011 – jako pilot promu Discovery uczestniczył w misji STS-133. Sierpień 2012 – został zastępcą szefa Biura Astronautów NASA. 9 lipca 2015 – agencja NASA ogłosiła, że Boe został jednym z czterech astronautów wybranych do szkolenia i przygotowań do testowych lotów na prywatnych statkach kosmicznych firm SpaceX (statek Dragon V2) i Boeing (CST-100 Starliner), budowanych w ramach Commercial Crew Program. Docelowo statki te mają być wykorzystywane przez NASA do transportu astronautów na stację ISS oraz powrotu ze stacji na Ziemię.
Odznaczenia i nagrody Defense Meritorious Service Medal Meritorious Service Medal Air Medal – dwukrotnie Aerial Achievement Medal – pięciokrotnie Air Force Commendation Medal – dwukrotnie Air Force Achievement Medal Combat Readiness Medal Air Force Outstanding Unit Award – trzykrotnie National Defense Service Medal – dwukrotnie Armed Forces Expeditionary Medal Global War on Terrorism Service Medal Command Pilot Wings Fannie and John Hertz Foundation Fellowship Universal Astronaut Insignia za lot orbitalny (nr 484) – Stowarzyszenie Uczestników Lotów Kosmicznych ()
Wykaz lotów